原來、付廷正到達江陰以後，江陰就在長江邊上，所以他的艦炮都用得上。他也是採取了先用大炮轟開江陰的城門，然後帶兵進入了江陰。
他佔領了江陰以後，在江陰建立政權。也進行了土改運動。這也是王乾的命令，每佔領一個縣城，必須進行土改運動和憶苦思甜活動。
付廷正在江陰留下了2000人，鎮守江陰。然後直接開著軍艦，往長江上游去了，他要先佔領常州府，他攻打常州府就不是那麼順利了。
常州府的守將是滿人，他帶領清軍誓死守衛常州府。而這一支清軍也非常的精銳，在傅廷正的機槍加大炮的攻擊下，可以說是戰鬥到了最後一人。當付廷正轟開城門，進入常州城內的時候，他沒有看到站著的清軍。這使得付廷正非常抑鬱。
付廷正穩定了常州以後，把軍隊一分為二。他讓他的副將王軍率領一支隊伍，進佔長江北岸的靖江。他自己則帶人南下佔領了荊溪。也就是現代的宜興。
這時候兩江總督蘇凌阿才反應過來。急忙調兵遣將往常州殺來。他又調動長江的水師順流而下直撲蘇州，可惜已為時已晚。
瞿江濤的艦隊已進駐了江陰。牢牢地把。清軍水師堵在了長江中上游。長江水師到達江陰以後同瞿江濤的艦隊幹了一仗，瞿江濤的三艘軍艦隻進行了一輪齊射，就滅掉了長江水師的六艘艦船。嚇得長江水師一溜煙跑回安徽去了。都不敢再在江蘇境內停留。
而從陸上來進攻常州的清軍，在江蘇巡撫費淳的帶領下 剛剛進入常州地界，便遭到了付廷正軍隊的埋伏。自巡撫以下，全軍覆沒。這裡，兩江總督蘇凌阿趕緊寫摺子向皇帝告急。請求嘉慶帝調集周邊的部隊來剿滅蘇州的義軍。
可是這時嘉慶帝已經是焦頭爛額。他哪裡還有兵來管江蘇的事情。他便下了一道聖旨，狠狠地斥責了兩江總督一通，又撤掉費淳，任命康吉田為巡撫，然後命令他二人就地徵集鄉勇民壯，自行剿滅義軍。