以至於被三號機靠近，伸出變長的手臂卡住他的脖子也沒有進行反抗.....
甚至說出了：“自己死了也比殺人好這種話......”
真嗣完全沒有考慮過，如果不阻止三號機體的話，死的不止他一個....
由於真嗣的“沒有行動”導致碇源堂對他十分失望，他果斷髮布命令，切除了真嗣與初號機的聯繫，採取了由【傀儡系統】來操控初號機。
碇源堂的決斷為“就算傀儡系統還有很多問題，但是就算如此也比現在的駕駛員要好！”
真嗣的駕駛艙內，脖子被掐住的感覺立刻消失，因為他與初號機的連接被切斷了，四周的光線變得昏暗。
初號機由傀儡系統操控，馬上開始了反擊，同樣伸出手掐住了三號機的脖子，慢慢的，初號機站起了身，但從力量上來說，已經完全壓制住了三號機。
NERV總部的人員全都不可置信的看著參數，各項增益正在顯著提高，看起來，這是來自“傀儡系統”的力量。
真嗣在駕駛艙內就那麼眼睜眼看著初號機扭斷了三號機的脖子，這還沒完，初號機將三號機狠狠摔在地上，一拳砸出，三號機被這一拳砸的血液狂噴！
“嗚啊！！！”
初號機發出怒吼，開始瘋狂撕扯著三號機，護甲被拆掉，肢體被分解，四周的大樓上全都是鮮血，路邊的紅綠燈上夜，粘稠的血液一滴滴往下流，邊上的河道徹底被染成紅色。
“呀滅樓！！！”
“快讓他停下！爸爸！！”
“快叫他停下來！”
真嗣在駕駛艙內歇斯底里的大吼。
NERV總部的一眾人全都目瞪口呆的看著屏幕，膽小的女性已經用手捂住了臉了...
最終，在真嗣驚恐的眼神中，初號機的手中抓著一個插入栓，也就是駕駛者所在的駕駛艙。
“住手！”
“快住手！”
真嗣瘋狂的拉動著手中的操縱桿，但是卻沒有任何用處。
砰！！
初號機將插入栓捏爆了！
“EVA三號機，不對，目標已經完全癱瘓.....”
NERV總部內，傳出了這最後的通知。
目標已被消滅，初號機站立在原地，進入了待機模式。