到達南京後，熊文燦先是與王家楨做了簡單的交接工作。
隨後，熊文燦便傳檄五省巡撫及總兵，前來南京議事。
九月十日。
直隸、河南、山東、四川及湖廣等地的巡撫及總兵，應召來到南京議事。
在會議上，熊文燦先是對崇禎皇帝大拍馬屁，感激崇禎皇帝對他的重任。
隨後，他又發表了一番對流賊的痛恨。
可之後的畫風，卻是讓眾人摸不著頭腦。
熊文燦竟然開始提出，以‘招降為主，圍剿為輔’的剿賊理念。
眾人對此是大跌眼鏡，不明白熊文燦為何會這麼做。
其實，熊文燦也是自家知道自家事，有苦難言。
他自知自己不是統兵打仗的料，也無半點的軍事才能。
平定福建的海患，也都是靠著招撫的方式。
如今，崇禎皇帝命他擔任五省總理，負責圍剿流賊。
這簡直就是趕鴨子上架，強人所難。
為此，熊文燦在赴任五省總理時，還特地到江西廬山，拜訪他的好友空隱和尚，詢問圍剿流賊之策。
面對熊文燦的詢問，空隱和善嘆道：君既無統兵之能，麾下又無精兵良將，皇上卻給你這樣的高位。
一旦剿賊失敗，那就與三邊總督楊鶴一樣，被斬首示眾，傳首九邊。
熊文燦良久才言：如今赴任在期，心中卻仍無剿賊之策，唯有實行招撫之策了。
隨後，空隱和尚給了熊文燦一個主意。
若流賊真被招撫成功，切記要防備流賊詐降，如發現流賊有再度起事的苗頭，一定要及早的扼殺。
因此，非常明白自己處境的熊文燦，在到達南京後，才會說出招撫流賊之策。
而五省巡撫及總兵們見自己的頂頭上司決定招撫流賊，雖心中覺得有些不妥，但既然領頭上司決定了，那自己也沒有必要再去反對。
隨後，在統一確定了招撫流賊的策略後，熊文燦開始派人在南直隸各府，張貼招撫告示。
並言明道：如若主動來降，將免去以前所犯之罪，並賜予官位。
這告示一張貼出來，立即就引起了軒然大波。
有明智之人勸言，流賊非與海寇相比，且流賊詐降之事已是發生過好幾次，實難讓人信任，切不可行招撫之策，當以重兵剿之才行。
對於這些人的勸言，熊文燦一概是不予理會。
他當然也知道，招撫流賊是一個危險的策略。
一個沒做好，那就是要翻船，人頭落地了。
但熊文燦不得不這樣做，因為他實在想不出，除了這個辦法外，還有什麼辦法可以平定流賊。
不過，熊文燦也不是一味的實行招撫。
畢竟在他的麾下，還有著左良玉這樣的良將，兵力也能抽調出四五萬人。
在實行招撫的同時，也需要剿滅一些流賊，以此達到震懾流賊的目的，從而讓流賊心生畏懼之心。
這樣也就更加方便招撫之策的實施了。
九月十二日。
熊文燦賞發三萬兩白銀，命左良玉加緊對張獻忠等流賊的追剿。