內閣制度形成以後，皇帝擔心內閣權力過於龐大，於是建立了司禮監來制衡內閣。開始的時候司禮監權力並不大，並且受到皇帝的嚴格限制，但是到了明朝中後期，內閣權力急劇膨脹，皇帝擔心內閣權力過於大，賦予司禮監太監權力，相互制約，以求平衡。具體行政流程是：內閣對國家的政治提出處理意見，是以“票擬權”的形式參政、議政權，然後交給皇帝批閱，明朝後期皇帝怠政，審批的權利被皇帝劃歸到司禮監太監的手上，等於是分得了皇權的一部分，司禮監權力急劇膨脹，出現了王振、劉瑾等權勢滔天的太監。這就是閹當的由來了。皇帝不斷的下放權力，不斷的培養宦官監察百官，這惹得那些文官十分的牴觸！
試想，自己十年寒窗無人問，一朝上榜入廟堂，當官就是為了當人上人，沒成想，進了廟堂自己歸一幫太監管了！可笑可笑！
然而，內閣首輔這一重要職務，並不是由皇帝親自決斷，而是朝廷官員推薦，皇帝最終行使決定權。這樣就催生了明朝中後期不同黨派的競爭。為了爭奪首輔這一權力，相互鬥得死去活來，本來想用這種制度讓朝廷政治清明一些，結果卻搞得烏煙瘴氣、亂七八糟，更使得明朝社會危機四伏。
諸如內閣首輔張居正，為了爭奪首輔這一職位，用盡各種手段，趕跑了原來的首輔高拱，自己坐上首輔的寶座。這其中的血雨腥風，不足以為外人道也！
朱元璋廢了丞相，朝中大量的政務就得他親自處理。皇帝事必躬親並不是件壞事，但龐大的工作量一個人根本不能完成。所以，朱元璋用了幾個文士給自己當一下顧問，這些人都是五品以上官員，扮演著非常重要的參謀角色。
可以說，內閣成員開始的時候就是幫皇帝寫寫文稿、出點主意而已，到了仁宗時期，已經加銜至尚書侍郎，並且都在皇帝身邊，自然權力增大了很多。到英宗少主登基的時候，大學士的“票擬權”顯得尤為重要，內閣矛盾也就自然越來越激烈了。
萬曆十五年以後萬曆皇帝曾經多年不上朝，但是國家依然正常運轉，期間還打了三場戰爭，最著名的就是抗擊日寇增援朝鮮的戰爭，取得了勝利，內閣在其中發揮了不可或缺的作用。但是，竟然前後換了19任內閣首輔，這也使得政策不能持續執行，最後導致滅亡。
皇帝把手中權力分別給了太監、內閣、六部、東廠、錦衣衛等，所以，明朝內閣權力依附皇權的事實不容置疑，也就不可能成為現代意義上的內閣政治制度，更不可能成為英日的內閣制度。這兩者之間有個根本區別！