會議結束後，王鴻濤又召集衛生部領導班子會議，聽取了魏海鵬做的工作彙報和4個方面的專題彙報。
王鴻濤向被領導班子通報巡視目的和任務，公佈巡視組監督的範圍、工作安排和聯繫方式。
並於當日，在衛生部辦公樓大廳以及大院大門，還有直管單位、聯繫單位張貼了巡視公告，設立了舉報箱，歡迎廣大幹部群眾對巡視組進行監督，提出意見建議。
巡視組的食宿被安排在衛生部制定接待酒店，有專人負責巡視組的飲食起居，辦公廳主任全天候在酒店待命，配合巡視工作，協調各部機關各司局、委直屬和聯繫單位，隨時提供巡視組所需材料。
9月7日，王鴻濤和副組長李明和部分巡視成員，前往食藥局，和局長程堅見面後，按照流程召開了動員會，交代了巡視相關事宜。
程堅局長堅持要負責巡視組的後勤保障，被王鴻濤拒絕了，要求兩個單位合併辦公，都在衛生部提供的酒店進行資料收集。
對兩個部委的巡視正式開始，一起都按照程序有條不紊的進行，李明副組長負責把關資料收集，但是兩個部委領導都知道，明面上的問題不是問題，就怕王鴻濤背後出什麼么蛾子，而且他們確定以及肯定，王鴻濤一定會出么蛾子，因為王鴻濤已經在網絡上發佈了巡視公告，號召廣大網民對兩個部委的工作巡視提出意見和需要整改的方向。
按照王鴻濤的說法，是要調動廣大服務對象的積極性，部委服務的是全國人民，群眾當然有監督舉報的權利。
有冤不伸枉為人，有仇不報非君子！能夠巡視這兩個單位，王鴻濤做夢都能笑醒，敢不效死命！
堡壘往往是從內部攻破的，不管你有多大的能耐都不要囂張，在巡視組進駐的第二天，就收到了大量關於離退休幹部局監察專員孫軍的舉報，涉嫌嚴重違紀違法。
資料顯示，孫軍長期從事幹部保健工作，曾在保健局工作多年，曾任保健局預防與健康教育處處長、衛生部保健局常務副局長等職。
核實後，王鴻濤立即上報巡視工作領導小組，並轉辦駐衛生部紀檢組。
9月10日，中紀委網站發文稱，衛生部監察專員孫軍涉嫌嚴重違紀違法，目前正接受紀律審查和監察調查。