9月5日，第二輪巡視工作正式開始，第五巡視組正式給衛生部和食藥局下發巡視通知。
9月6日早上，巡視組正式進駐衛生部，王鴻濤主持召開與衛生部部長魏海鵬的見面溝通會，傳達了關於巡視工作的重要指示精神，通報了有關工作安排。
魏部長表示全力配合巡視工作，並委派副部長王強做好巡視組的後勤保障工作。
下午，第五巡視組巡視衛生部黨組工作動員會召開。
王鴻濤作了動員講話，對做好巡視工作提出要求。魏海鵬主持會議並講話。
第五巡視組副組長及有關同志，巡視辦有關同志，紀委駐衛生部紀檢監察組有關負責同志，衛生部領導班子成員出席會議，部機關各司局、委直屬和聯繫單位主要負責同志，機關紀委、巡視辦、巡視工作聯絡組負責同志列席會議。
王鴻濤強調，部委機關單位是貫徹落實黨中央決策部署的“最初一公里”，對部委機關單位開展巡視，彰顯了以上率下、推進自我革命的高度自覺。巡視組將緊盯黨組職能責任階段性主要矛盾、緊盯領導班子和關鍵少數、緊盯人民群眾反映強烈的突出問題，深入瞭解落實中央重大決策部署情況，以及制度執行、深化改革和防範化解重大風險情況；加強對主體責任和監督責任落實、權力運行和監督制約情況的監督；加強對領導班子建設、選人用人、機關黨建和幹部擔當作為情況的監督；瞭解落實巡視、審計等監督發現問題整改情況，推動部委機關建設成為講政治、守紀律、負責任、有效率的模範機關。
魏海鵬表示，這次第五巡視組到我部巡視，是對我部黨組的一次全面“政治體檢”，我們要把接受巡視監督作為查找問題、正視差距、改進作風、推動工作的重要契機，實事求是彙報工作，全面客觀反映情況，全力支持配合巡視組開展工作。要把解決問題作為巡視整改的出發點和落腳點，壓緊壓實責任，做到即知即改、立行立改、全面整改，確保取得實效。要運用好巡視成果，舉一反三，形成常態化、長效化機制，全面提升部直屬機關黨建質量，引領衛生事業高質量發展，不辜負中央和人民群眾的期望。