擇選全軍主帥和各路統帥，以大將軍、驃騎將軍、車騎將軍、衛將軍等充任；
將軍開府置幕僚，組成指揮機構。
武帝以後，大將軍及其幕府長期設置，戰時指揮作戰，平時參與朝政，實權甚大。
在地方，漢朝郡、國並行。
郡置太守，為地方最高軍政長官，以都尉輔佐掌管兵員徵集、訓練、考核校閱、維持治安、率軍出征，以及武器裝備的製造、管理等。
郡下設縣，縣令(長)兼理軍、民兩政，置縣尉助理軍事和掌管治安。
與郡平行的諸侯王國，以相為行政長官，兼掌軍事。
臣王國中尉、郎中令、衛尉等統領軍隊，負責王宮宿衛和維持王國治安。
縣下還有鄉、亭等基層組織，各置官吏，兼掌組織本地正卒訓練和治安、郵驛、戶籍、兵役等軍政事務。
東漢時，裁罷都尉，其職併入太守。
原來作為監察區劃的州(部)，逐漸演化為郡之上的行政單位，州刺史內掌民政，外統兵馬，地方官權力膨脹。（注，文中符驍的外祖父齊長錚，便為茁州刺史。）
黃巾起義後，戰爭頻仍，刺史、郡守不僅有領兵權，還有徵兵、募兵權，從而埋下了分裂割據的種子。
兵役制度：兩漢兵役制度有一個明顯的演變過程。
漢初，承秦制，實行徵兵制。
文帝時，正常徵發不能適應戍邊需要晁錯建議募民實邊，使邊郡常駐之民與常駐之兵合而為一。
武帝時，土地兼併日趨嚴重，大批小農破產流亡，豪宮之家多有免除兵役的特權，又戰事頻繁，兵員需要量大，過去行之有效的徵兵制度不能正常進行，也無法滿足戰爭的需要，於是，兼行募兵制。
此外，如謫兵、奴兵、少數民族兵也被廣泛使用。東漢，劉秀改革軍制，取消郡縣正卒輪流上制度，兵員以招募為主。
漢初，民17歲博籍(登記)，成為具有兵役義務的待役人員，稱為“正”。
“正”20或23歲起役，輪流應徵，服現役兩年。
一年在本郡為材官或騎士、樓船了；
一年赴京師當衛士，或到邊郡充戍卒(一說在本郡為材官、騎士、樓船，是正卒；衛士、戊卒為同樣性質的服役，均不是正卒。前者系兵役，後者系搖役)。
“正”不服役時，為預備役兵員，遇有戰事，須隨時應徵，到60或56歲止。應役年限內的免役，分為復身(本人免役)、夏家(全家免役)兩種。
凡有一定軍功、資歷、爵位者，飼養、捐獻軍馬或糧食、錢幣達到一定數量者，朝廷禮遇的功臣子孫、學者、高齡者，男子身高不足規定尺寸(6．2尺以亡)者，均可免役。
武帝開始，兼行募兵制。
初募熟悉胡、越的漢族及少數民族人當兵，不再按期更代。
其後，四方有事，常募兵以備征伐。
用募對象多數是農民、流民，少量是犯罪而持許免罪(弛刑)的官吏或百姓，以及被放免的奴隸。