他的研究表明，真核生物，很可能不是古菌的“兄弟”。
而是古菌的“兒子”。
古菌和真核生物的關係，是“父子”。
所以應該只存在兩個域，古菌域和細菌域，真核生物只不過是一個分化子界。
三域有根生命樹和二域有根生命樹誕生時間近似，互相之間有很多研究發現是可以見證的。
隨著基因測序工作進展和全世界的學者們的研究發現，在小小的細胞之中發掘出來的證據，時而偏向三域學說，時而又倒向二域學說。
但人力畢竟有限，科學技術的發展和基因測序工作進度也不能一蹴而就。
生命到底是分三域還是分兩域，至今也沒有個定數。
這讓兩種學說針鋒相對，分別支持這兩種學說的學者都在不斷地試圖發掘新證據來證明自己學說的正確性。
但從新的研究發現上來看，二域學說，現在取的的證據更多。
美國生物學家雷·馬古利斯（Lynn·Margulis）在1970年出版的《真核細胞的起源》中提出了“內共生假說”。
假說中的她認為：好氧細菌被變形蟲狀的原始真核生物吞噬後、經過長期共生能成為線粒體，藍藻被吞噬後經過共生能變成葉綠體，螺旋體被吞噬後經過共生能變成原始鞭毛。
提取關鍵詞後，就是：“吃”和“不消化”。
真核生物，是原核生物吃掉其他細胞的細胞器後，沒有消化掉，而是利用起來，轉換成了自己身上的部件。
在漫長的演化時間長河中，這種情況持續下去，就會催生出各種各樣的，全新的“原核生物”，甚至乾脆就是吃多了，完成了從原核生物到真核生物的蛻變。
她1981年的《細胞進化中的共生》中還提到：“真核細胞起源於相互作用的個體組成的群落”。
要知道，原核生物和真核生物的區別就在於哥哥完善的細胞核，和能夠再分化形成的細胞器。
如果該假說成立，那原核生物和真核生物的距離，就會再進一步。
內共生假說，支持的是二域學說。
時間再往後。
1998年，比爾·馬丁（Bill Martin）和米克洛什·米勒（Miklos Muller）兩位科學家提出了“氫假說”。
真核生物最有可能出現的情況是，它們起源於一種共生關係，在這種共生關係中，宿主是古生物細胞，共生體是細菌。古生菌宿主的新陳代謝依賴於氫，線粒體的前體產生了氫。